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首页> 外文期刊>Journal of the American Society of Brewing Chemists >Comparative Study of Two Plasmids, pRH45 and pRH 20690, Isolated from Beer-Spoilage Lactobacillus brevis ABBC45 and L. lindneri DSM20690~T
【24h】

Comparative Study of Two Plasmids, pRH45 and pRH 20690, Isolated from Beer-Spoilage Lactobacillus brevis ABBC45 and L. lindneri DSM20690~T

机译：从啤酒腐败的短乳杆菌ABBC45和L. lindneri DSM20690〜T分离到的两个质粒pRH45和pRH 20690的比较研究

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El análisis de mancha Southern con Lacotovacilus lindneri DSM 20690~T demostró la presencia la presencia del homologue horA., un gene con resistencia a lúpulo identificado originalmente en L. brevis ABBC45. El homologue horA encontrado en L. lindneri DSM 20690~T era llevado por un plasmido señalado pRH20690. Este plasmido es similar en tamaño a pRH45, un plasmido que mantiene el gene horA en L. brevis ABBC45. El análisis completo de secuenciación de pRH20690 reveló que este plasmido de 13.0-kb es muy similar en la organización de bastidores abiertos de lectura (ORFs) a el de pRH45. Las regiones de origen de réplica supuestas y la codificación ORFs supuesto del gene rep fueron encontrados ser 99.0 y 100.0% idénticos, respectivamente, entre las dos cepas de deterioración de cerveza, indicando que estos dos plasmidos comparten el mismo origen. Se demostró a fondo que las porciones de DNA 6.9-kb de los plasmidos conteniendo seis supuestos ORFs son 99.4% idénticos en secuencia nucleotide, sugiriendo que las cepas resistentes a lúpulo de Lactobacillus adquirieron horA por transferencia horizontal de gene mediado por plamido. Esta hipótesis potencialmente provee a los cerveceros una base teórica para aplicar marcadores genéticos de transporte de especie, tales como horA, para complementar los acercamientos específicos a especie tradicionales.%Southern blot analysis with beer-spoilage Lactobacillus lindneri DSM 20690~T showed the presence of the homologue of horA, a hop-resistance gene originally identified in L. brevis ABBC45, The horA homologue found in L. lindneri DSM 20690~T was carried by a plasmid designated pRH20690. This plasmid is similar in size to pRH45, a plasmid harboring horA gene in L. brevis ABBC45. The full sequencing analysis of pRH20690 revealed that this 13.0-kb plasmid is remarkably similar in the organization of the open reading frames (ORFs) to that of pRH45. The putative replication origin regions and the ORFs encoding a putative rep gene were found to be 99.0 and 100.0% identical, respectively, between the two beer-spoilage strains, indicating that these two plasmids share the same origin. It was further shown that the 6.9-kb DNA portions of the plasmids containing six putative ORFs are 99.4% identical in nucleotide sequence, suggesting that the hop-resistant Lactobacillus strains acquired horA by plasmid-mediated horizontal gene transfer. This hypothesis potentially provides brewers with a theoretical basis for applying trans-species genetic markers, such as horA, to complement the traditional species-specific approaches.
机译：用马氏梭状芽胞杆菌DSM 20690〜T进行的Southern印迹分析证明存在horA。Homolog，这是一种最初在短乳杆菌ABBC45中鉴定出的啤酒花抗性基因。在L. lindneri DSM 20690〜T中发现的horA同源性由命名为pRH20690的质粒携带。该质粒的大小与pRH45相似，pRH45是在短乳杆菌ABBC45中维持horA基因的质粒。对pRH20690的全序列分析表明，该13.0kb质粒的开放阅读框（ORF）组织与pRH45非常相似。发现在两个啤酒腐败菌株之间，rep基因的假定复制起点区域和假定ORF分别为99.0和100.0％相同，表明这两个质粒具有相同的起点。彻底证实含有六个推定的ORF的质粒的6.9-kb DNA部分在核苷酸序列上具有99.4％的同一性，这表明，通过质粒介导的水平基因转移，对乳酸菌的啤酒花抗性菌株获得了horA。该假设可能为啤酒酿造者提供应用遗传物种转运标记（例如horA）以补充传统物种特异性方法的理论基础。％啤酒腐败林德氏乳杆菌DSM 20690〜T的Southern印迹分析表明存在最初是在短乳杆菌ABBC45中鉴定出的一种啤酒花抗性基因horA的同源物，而在L. lindneri DSM 20690〜T中发现的horA同源物则被称为pRH20690的质粒所携带。该质粒与pRH45相似，pRH45是在短乳杆菌ABBC45中带有horA基因的质粒。对pRH20690的全序列分析表明，此13.0-kb质粒的开放阅读框（ORF）组织与pRH45非常相似。发现两个啤酒腐败菌株之间的假定的复制起点区域和编码假定的rep基因的ORF分别为99.0和100.0％相同，表明这两个质粒具有相同的起点。进一步显示，含有六个推定的ORF的质粒的6.9-kb DNA部分在核苷酸序列上具有99.4％的同一性，这表明耐啤酒花的乳酸杆菌菌株通过质粒介导的水平基因转移获得了horA。该假设可能为酿酒商提供应用跨物种遗传标记（例如horA）以补充传统物种特定方法的理论基础。

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