竹亚科叶绿体DNA条形码筛选

张玉霄; 许宇星; 马朋飞; 张丽娜; 李德铢

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竹亚科叶绿体DNA条形码筛选

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竹亚科是一个形态上鉴定困难且易于混淆的类群。DNA条形码技术为这一类群的鉴定提供了一个辅助手段。核心条形码（rbcL+matK）在竹亚科中的鉴别率很低,因此,有必要针对竹亚科筛选有效的DNA条形码片段。本研究根据已发表的竹亚科叶绿体基因组序列,筛选出16个片段,包括1个基因片段和15个基因间隔区,选取青篱竹族和箣竹族的10属22种30个个体,进行引物通用性、测序成功率和变异位点分析。研究结果表明:（1）引物具有较高的扩增成功率,但部分片段中由于存在poly结构造成测序失败;（2）片段中的插入/缺失可以编码,作为信息位点;（3）trnG-trnT（t）具有最多变异位点,建议可作为竹亚科优先选择的DNA条形码;（4）在开展不同类群的DNA条形码和分子系统学研究时,可以按照"trnG-trnT（t）+X"的方式选择合适的叶绿体DNA片段。

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来源
《植物分类与资源学报》 |2013年第6期|743-750|共8页
作者
张玉霄; 许宇星; 马朋飞; 张丽娜; 李德铢;
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作者单位

1. 中国科学院昆明植物研究所生物多样性与生物地理学重点实验室 2. 中国科学院昆明植物研究所中国西南野生生物种质资源库 3. 西北农林科技大学生命科学学院 4. 中国科学院大学;

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正文语种 chi
中图分类植物分类学（系统植物学）;
关键词
竹亚科; DNA条形码; 插入/缺失; 分子系统学; 叶绿体片段筛选;

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