六个核基因片段在中国颗粒野生稻中的单核苷酸多态性及其在群体遗传学研究中的应用

吴春燕; 高立志

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为了筛选可用于亚洲栽培稻的重要野生近缘物种颗粒野生稻群体遗传结构研究的有效SNPs标记,本研究共选取Osgstf3、OsNAC6、BADH、XCP2、EMF2和ERCC4 6个重要水稻功能基因,检测了来自中国云南和海南12份颗粒野生稻代表样品中的单核苷酸多态性,结果发现Osgstf3、OsNAC6、BADH和XCP2的单核苷酸多态性接近于零,但在EMF2和ERCC4内含子区中检测到较低的核苷酸变异。利用EMF2和ERCC4片段对来自云南的3个天然群体和来自海南的2个天然群体共52个个体进行了群体遗传学研究,发现该物种具有高水平的遗传分化和低水平的遗传变异的独特群体遗传结构;这种剧烈的遗传分化不仅来自云南和海南两个地区之间,而且还来自地区内居群间,说明该野生稻生长的热带、亚热带森林生境的破坏导致了碎裂的居群间基因流强烈受阻。

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来源
《植物分类与资源学报》 |2013年第5期|537-546|共10页
作者
吴春燕; 高立志;
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作者单位

1. 中国科学院昆明植物研究所中国西南野生生物种质资源库植物种质资源与基因组学研究中心 2. 中国科学院大学;

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正文语种 chi
中图分类野生稻;
关键词
核基因; 颗粒野生稻; 单核苷酸多态性; 遗传变异; 群体遗传结构;

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