2017年云南省登革病毒Ⅰ型分离株NS1基因的鉴定及分析

文送娇; 林垚; 席珏敏; 王晓丹; 陈俊英; 潘玥; 叶超; 管娇琼; 洪姗; 孙强明

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目的鉴定并分析2017年云南省登革病毒Ⅰ型(dengue virusⅠ,DENVⅠ)分离株的NS1基因。方法采用病毒RNA提取试剂盒提取登革热(dengue fever,DF)患者血清RNA,RT-PCR法鉴定病毒类型,并扩增DENVⅠ的NS1基因,进行测序。应用BIOEDIT软件比对NS1及DENVⅠ标准株(DQ672562.1)的核苷酸及氨基酸序列,并进行突变分析。应用MEGA 5.1软件中的NJ法(1000 Boot strap replicate)构建NS1基因的系统进化树。结果共分离获得16株DENVⅠ的NS1基因,经比对发现,201703、201704、201708、201709、201713分离株NS1基因第21位碱基由C变为T(无义突变);201705、201706、201712分离株NS1基因第289位碱基由T变为A(有义突变),氨基酸曲L变为M。16株分离株NS1基因其他突变位点均相同,共85处发生碱基突变,其中5个为有义突变。16株分离株与2011-China Donggua(JQ048541.1)、2008-Singapore(GU370049.2)、2014-Taiwan(KU365900.1)、2005-China Fujian(DQ193572.1)、2016-Malaysia(KX452065.1)、2007-Indonesia(KC762646.1)、2015-South Korea(KP406802.1)、2006-Japan(AB178040.1)、2007-Thailand(HM469966.1)、2013-singapore(KJ806945.2)有较近的亲缘关系。结论 2017年云南省16株分离毒株均为DENVⅠ,可能属于东南亚国家的输入性毒株。

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来源
《中国生物制品学杂志》 |2018年第5期|456-461|共6页
作者
文送娇; 林垚; 席珏敏; 王晓丹; 陈俊英; 潘玥; 叶超; 管娇琼; 洪姗; 孙强明;
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作者单位

中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所云南省重大传染病疫苗研发重点实验室;

云南昆明650118;

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正文语种 chi
中图分类基因工程的应用;
关键词
登革病毒; NS1基因; 基因突变; 系统进化分析;

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