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乌骨鸡和珍珠鸡BF2与β微球蛋白(β2m)基因克隆及品种多态性分析

         
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克隆了乌骨鸡(BF2*SI)和珍珠鸡(BF2*NM)群主要组织相容性复合体Ⅰ(MHC class Ⅰ)和β微球蛋白(β2m)基因,分析了其分子特征与等位基因多态性.BF2*SI相互间氨基酸同源率为75.5%～93.9%,保留了人关键性氨基酸.BF2*NM相互间氨基酸同源率为81.1%～98.5%,保留了人HLA-A2与抗原多肽结合的7个HLA-A2与抗原多肽结合的6个关键性氨基酸.BF2*SI在α1和α2区(抗原多肽结合区,PBD)有24个高置换率位点,置换率最高的为69位和9位.BF2*NM在PBD区共有6个高置换率位点.BF2*SI PBD发生氨基酸置换的位点数大于来航鸡BF2,BF2*NM PBD区氨基酸置换的位点数和置换率则远远小于来航鸡BF2.根据同源率,将BF2*SI α1区分为4类,α2区分为3类,α3区分为3类,并由此聚类为5个系谱(A～E).将BF2*NMα1区分为3类,α2区分为3类,α3区分为1类,并由此聚类为3个系谱(A～C).比较发现BF2*03SI、BF2*04SI和BF2*05NM的α1区与抗马立克氏病的BF2*21同源率最高(分别为86.4%、86.4%和87.5%);BF2*05SI和BF2*05NM的α2区与BF2*21同源率最高(均为93.4%).另外,根据成熟肽区的氨基酸序列可将乌骨、珍珠鸡β2m分为两类,第一类和来航鸡β2m(M84767)氨基酸序列完全相同,第二类与第一类相比,氨基酸序列相互间同源率为85.7%.结果揭示了各类鸡的MHCⅠ和β2m基因具有品种分子特征.

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